1、两者所指的范围存在区别，破产费用是在破产程序进行和债务人财产管理过程中支出的常规性、程序性费用法。
商而共益债务是在破产程序中为了债权人的共同利益而支出的不确定费用。
2、清偿顺序不同，当债务人的财产能够完全支付这两种费用的时候，不存在支付顺序问题；
当债务人的财产不能完全支付所有的破产费用和共益债务的时候应当先清偿破产费用。

《中华人民共和国企业破产法》第四十三条
破产费用和共益债务由债务人财产随时清偿。
债务人财产不足以清偿所有破产费用和共益债务的，先行清偿破产费用。
债务人财产不足以清偿所有破产费用或者共益债务的，按照比例清偿。
债务人财产不足以清偿破产费用的，管理人应当提请人民法院终结破产程序。
人民法院应当自收到请求之日起十五日内裁定终结破产程序，并予以公告。