食品经营许可证的变更流程：
1、到工商行政管理部门提交食品经营许可变更申请书；
2、填写市卫生局卫生许可证申请书；
3、新增产品的，按新产品审查进行，所需资料也一样要求；
4、减少产品的，仅需递交申请报告；
5、原卫生许可证副本原件、工商营业执照复印件。食品经营许可证编号不变，发证日期为食品药品监督管理部门作出变更许可决定的日期，有效期与原证书一致。
法律规定：
根据《食品卫生法》的规定，食品生产经营企业和食品商贩，必须先取得卫生许可证，方可向工商行政管理部门申请登记或者变更登记。卫生许可证的发放管理方法由省、自治区、直辖市人民政府卫生行政部门规定。