主要区别有五点：
1、个体工商户设立不用验资；
企业（公司）需要验资；
2、个体工商户是无限责任，家庭财产承担连带责任；
公司是有限责任，只承担注册资金内的债务或清算责任；
3、个体工商户一般为固定税，由税务核定；
公司一般为比例税，按小规模、一般纳税人等套用税率；
4、个体工商户一般没有健全的财务制度，不用每月报表；
公司则需要建账、报表；
5、个体工商户年检时不需要报表审计；
公司年检时一般需要提交年度财务审计报告。

《公司法》第二十六条
有限责任公司的注册资本为在公司登记机关登记的全体股东认缴的出资额。
法律、行政法规以及国务院决定对有限责任公司注册资本实缴、注册资本最低限额另有规定的，从其规定。