知识产权海关保护的模式是被动保护模式和主动保护模式。
知识产权权利人在发现他人进出口货物涉嫌侵犯其知识产权时，有权向货物的进出境地海关提出扣留侵权嫌疑货物的申请和担保，海关在应权利人的申请扣留相关货物后，会及时通知权利人和货物收发货人。
《知识产权海关保护条例》第二条
本条例所称知识产权海关保护，是指海关对与进出口货物有关并受中华人民共和国法律、行政法规保护的商标专用权、著作权和与著作权有关的权利、专利权（以下统称知识产权）实施的保护。
第三条
国家禁止侵犯知识产权的货物进出口。 海关依照有关法律和本条例的规定实施知识产权保护，行使《中华人民共和国海关法》规定的有关权力。
第四条
知识产权权利人请求海关实施知识产权保护的，应当向海关提出采取保护措施的申请。