如果申请人撤回专利申请是在国务院专利行政部门已经作好了公布专利申请文件的印刷准备工作之后提出的，国务院专利行政部门仍可以作出撤回专利决定，但申请人提交的专利申请文件仍要予以公布，对于申请人的撤回专利声明在以后的专利公告上予以公告。
《专利法》第三条国务院专利行政部门负责管理全国的专利工作；统一受理和审查专利申请，依法授予专利权。省、自治区、直辖市人民政府管理专利工作的部门负责本行政区域内的专利管理工作。