在涉及敲诈勒索犯罪的司法实践中，本金能否从应罚金额中予以扣除往往取决于具体案情。当敲诈勒索行为已实际实施完毕，且相关涉案金额亦已明确界定之时，通常来说，本金是不能被从应罚金额中进行扣除的。然而，若有确凿证据表明被害人因受到恐吓或威胁而被迫支付超额款项，抑或是支付金额远远超过其合理承受范围的话，那么法院在作出最终裁决时便有可能会结合此类因素对相应罚金数额进行重新审视与厘定。至于在敲诈勒索犯罪尚未完全得逞的情形下，若被害人已向行凶者支付部分款项的情形，此部分款项便有望被视为整个敲诈勒索行为中所获得的收益之一，进而对最后的判刑结果产生相应的影响。不过，必须强调的是，任何关于敲诈勒索案件的最终判决都需紧密依据相关事实证据进行严密论证与分析。

《中华人民共和国刑法》第二百七十四条
敲诈勒索公私财物，数额较大或者多次敲诈勒索的，处三年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处或者单处罚金；数额巨大或者有其他严重情节的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金；数额特别巨大或者有其他特别严重情节的，处十年以上有期徒刑，并处罚金。