艾滋病病毒感染者在司法程序中不会被纳入罪犯之列进行拘禁或判决执行，而是适用监外执行的规定。
若其在监狱服刑期间被查出感染艾滋病病毒，将依法送至专门设立的监狱医院接受治疗和护理。
对于患有严重疾病、符合法定条件确实需要监外执行的罪犯，应由省级人民政府指定的医院进行诊断并出具相关证明文件。
在交付执行之前，暂予监外执行的决定权归属于交付执行的人民法院；而在交付执行之后，则由监狱或看守所提出书面申请，上报省级以上监狱管理机关或设区的市一级以上公安机关审批。

《刑事诉讼法》第265条
对被判处有期徒刑或者拘役的罪犯，有下列情形之一的，可以暂予监外执行：
（一）有严重疾病需要保外就医的；
（二）怀孕或者正在哺乳自己婴儿的妇女；
（三）生活不能自理，适用暂予监外执行不致危害社会的。