法院对妨害动物防疫罪既遂的处罚：
1、法院对构成本罪既遂的犯罪分子，一般应处三年以下有期徒刑或拘役，并处或单处罚金；
2、如果是单位犯本罪的，法院应对该单位处以罚金，并对其直接责任人员处以本罪个人犯相应的刑罚。

《刑法》第三百三十七条
违反有关动植物防疫、检疫的国家规定，引起重大动植物疫情的，或者有引起重大动植物疫情危险，情节严重的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金。
单位犯前款罪的，对单位判处罚金，并对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员，依照前款的规定处罚。