关于“非法行医罪”的立案基准，主要包括以下几个方面：已给患者带来轻伤程度的残疾、器官组织出现较为普遍的功能性障碍，抑或是重度及以上的残疾、器官组织遭受严重功能性障碍，乃至最终直接致其死亡；导致甲类传染疾病的大规模传播与流行，甚至具有持续传播和流行的潜在风险；使用任何假冒药物、低劣药品或者卫生条件不达标、医疗器材，都可能对人体健康造成极其恶劣的后果；以及其它一些相关的标准规定。

《最高人民检察院、公安部关于公安机关管辖的刑事案件立案追诉标准的规定（一）》第五十七条
未取得医生执业资格的人非法行医，涉嫌下列情形之一的，应予立案追诉：
（一）造成就诊人轻度残疾、器官组织损伤导致一般功能障碍，或者中度以上残疾、器官组织损伤导致严重功能障碍，或者死亡的；
（二）造成甲类传染病传播、流行或者有传播、流行危险的；
（三）使用假药、劣药或不符合国家规定标准的卫生材料、医疗器械，足以严重危害人体健康的；
（四）非法行医被卫生行政部门行政处罚两次以后，再次非法行医的；
（五）其他情节严重的情形。