对于一些轻微的刑事案件，其实也是允许当事人私了。但一般情况下私了的往往是刑事自诉案件，当事人达成和解协议之后撤诉，那么就不能再立案。
但要是公诉案件的话，当事人私了的部分仅仅是针对民事赔偿的部分，刑事部分是不能私了的。所以即使当事人之间私了了，之后反悔的话也还可以立案。

《刑事诉讼法》第二百一十二条
人民法院对自诉案件，可以进行调解；自诉人在宣告判决前，可以同被告人自行和解或者撤回自诉。本法第二百一十条第三项规定的案件不适用调解。
人民法院审理自诉案件的期限，被告人被羁押的，适用本法第二百零八条第一款、第二款的规定；未被羁押的，应当在受理后六个月以内宣判。