职务侵占罪的赔偿程序通常遵循以下步骤：
首先，犯罪行为人必须展示出真诚的赔偿意向，并向负责处理案件的司法机关明确表示这一点。
接着，司法机关将对行为人所提出的赔偿情况进行认真核实并记录在案。
其次，犯罪行为人可与受害单位就赔偿的具体方式及金额展开积极协商。
若双方能达成共识，便可签署赔偿协议。
随后，依照协议规定，犯罪行为人需将相应的款项或财产如数归还给受害单位。
在此过程中，司法机关将对整个过程进行严格的监督和确认。
最后，赔偿情况将成为衡量刑期长短的一项关键性参考因素。
在法院作出最终判决时，将会依据赔偿情况对被告的刑罚做出相应的减轻调整。

《中华人民共和国刑法》第二百七十一条
【职务侵占罪；贪污罪】公司、企业或者其他单位的工作人员，利用职务上的便利，将本单位财物非法占为己有，数额较大的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处罚金；数额巨大的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金；数额特别巨大的，处十年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处罚金。
国有公司、企业或者其他国有单位中从事公务的人员和国有公司、企业或者其他国有单位委派到非国有公司、企业以及其他单位从事公务的人员有前款行为的，依照本法第三百八十二条、第三百八十三条的规定定罪处罚。