在处理强奸罪相关的刑事诉讼程序中，一般而言，在公安部门的主导下展开调查工作，随后由检察机关代表国家向法院提出公诉请求，最后由法院依据充足的证据以及相关法律法规对犯罪行为作出裁决并量刑。
在此过程中，公安机关主要承担着搜集证据、明确案件事实真相的任务；
而检察机关则需要对案件进行全面审查，以决定是否正式向法院提起公诉；
最终，法院将根据所掌握的证据及法律规定，对犯罪嫌疑人做出相应的定罪与量刑判决。

《中华人民共和国刑事诉讼法》第三条
【职权原则严格遵守法定程序原则】对刑事案件的侦查、拘留、执行逮捕、预审，由公安机关负责。检察、批准逮捕、检察机关直接受理的案件的侦查、提起公诉，由人民检察院负责。审判由人民法院负责。除法律特别规定的以外，其他任何机关、团体和个人都无权行使这些权力。
人民法院、人民检察院和公安机关进行刑事诉讼，必须严格遵守本法和其他法律的有关规定。