在涉及到强奸罪案件的审讯过程当中，若是被告人与被害人的供述之间存在出入或者无法达到相互印证的情况下，法院及相关司法机构将会从各类证据入手进行全面审查，其中涵盖了证人证言、物证、鉴定意见以及监控录像等多种类型。这些证据将共同构成对案情真相的完整拼图，为法院的审判提供有力支持。
然而，若某份供述与其它证据形成明显冲突，并且不能通过合理手段排除合理疑点时，法院即有权力判定此类供述并不足以作为判决定罪的完全依据。基于此，遵循《中华人民共和国刑法》第二百三十六条之规定，对强奸罪进行定性必须具备充足的证据，从而能够证实犯罪事实确实发生过。因此，当供述出现分歧时，法院将依据所有已掌握的证据进行裁决。

《中华人民共和国刑法》第二百三十六条【强奸罪】以暴力、胁迫或者其他手段强奸妇女的，处三年以上十年以下有期徒刑。
奸淫不满十四周岁的幼女的，以强奸论，从重处罚。
强奸妇女、奸淫幼女，有下列情形之一的，处十年以上有期徒刑、无期徒刑或者死刑：
（一）强奸妇女、奸淫幼女情节恶劣的；
（二）强奸妇女、奸淫幼女多人的；
（三）在公共场所当众强奸妇女、奸淫幼女的；
（四）二人以上轮奸的；
（五）奸淫不满十周岁的幼女或者造成幼女伤害的；
（六）致使被害人重伤、死亡或者造成其他严重后果的。”