倘若曾在取保候审期间违反相关法律规定，虽然已缴纳了保证金，但仍需根据具体情况进行处理，包括但不仅限于以下措施：
未退还者应予以没收部分或全部保证金；
因具体事件需要，需强制要求其签署悔过书，并重新补充交纳保证金，或提出适当保证人；
对于情节较为严重者，甚至可取消其取保候审资格，直接对其实施逮捕。
同时，对于那些在取保候审期间违反规定且情节严重的犯罪嫌疑人、被告人，他们的取保候审资格有可能被撤销，进而依法实施逮捕。

《中华人民共和国刑事诉讼法》第七十一条
【被取保候审人的义务及违反义务的法律后果】被取保候审的犯罪嫌疑人、被告人应当遵守以下规定：
（一）未经执行机关批准不得离开所居住的市、县；
（二）住址、工作单位和联系方式发生变动的，在二十四小时以内向执行机关报告；
（三）在传讯的时候及时到案；
（四）不得以任何形式干扰证人作证；
（五）不得毁灭、伪造证据或者串供。
人民法院、人民检察院和公安机关可以根据案件情况，责令被取保候审的犯罪嫌疑人、被告人遵守以下一项或者多项规定：
（一）不得进入特定的场所；
（二）不得与特定的人员会见或者通信；
（三）不得从事特定的活动；
（四）将护照等出入境证件、驾驶证件交执行机关保存。
被取保候审的犯罪嫌疑人、被告人违反前两款规定，已交纳保证金的，没收部分或者全部保证金，并且区别情形，责令犯罪嫌疑人、被告人具结悔过，重新交纳保证金、提出保证人，或者监视居住、予以逮捕。
对违反取保候审规定，需要予以逮捕的，可以对犯罪嫌疑人、被告人先行拘留。