仅拥有土地使用权证书而没有房产所有权证书并不保证必然获得赔偿。
拆迁补偿制度及标准具有高度复杂性与地域差异，需根据具体的拆迁法规和相关政策文件，综合考虑如拆迁协议、拆迁公示以及被拆房产权等多方因素来核定赔偿金额。
尽管如此，无论是否持有土地使用权证书，只要能够提供房产所有权证书，便享有享有相应补偿权益的基本资格，原因在于我国法律体系认可房地权利的不可分性。
然而，土地性质的差异将直接影响到诸如拆迁补偿在内的诸多事项，例如通过公开市场竞价方式取得开发权的土地，开发商在取得该类土地的过程中所付出的土地成本相对于其他土地类型更高，因此在考虑给予的补偿费用时，也会适当提高其标准。

《中华人民共和国土地管理法实施条例》第三条
国家依法实行土地登记发证制度。依法登记的土地所有权和土地使用权受法律保护，任何单位和个人不得侵犯。
土地登记内容和土地权属证书式样由国务院土地行政主管部门统一规定。
土地登记资料可以公开查询。
确认林地、草原的所有权或者使用权，确认水面、滩涂的养殖使用权，分别依照《森林法》、《草原法》和《渔业法》的有关规定办理。