光伏发电系统拆迁应当依据《国有土地上房屋征收与补偿条例》进行补偿，其中的补偿金包括被征收房屋价值的补偿、因征收房屋造成的停产停业损失等三方面的补偿。
所以，如果要拆迁，光伏用户可以得到两部分补偿：
一个是光伏系统本身价值的补偿，另一个则是光伏未来几年发电总收入的补偿。

《国有土地上房屋征收与补偿条例》第二十一条
被征收人可以选择货币补偿，也可以选择房屋产权调换。
被征收人选择房屋产权调换的，市、县级人民政府应当提供用于产权调换的房屋，并与被征收人计算、结清被征收房屋价值与用于产权调换房屋价值的差价。
因旧城区改建征收个人住宅，被征收人选择在改建地段进行房屋产权调换的，作出房屋征收决定的市、县级人民政府应当提供改建地段或者就近地段的房屋。
第二十二条
因征收房屋造成搬迁的，房屋征收部门应当向被征收人支付搬迁费；
选择房屋产权调换的，产权调换房屋交付前，房屋征收部门应当向被征收人支付临时安置费或者提供周转用房。
第二十三条
对因征收房屋造成停产停业损失的补偿，根据房屋被征收前的效益、停产停业期限等因素确定。
具体办法由省、自治区、直辖市制定。
第二十四条
市、县级人民政府及其有关部门应当依法加强对建设活动的监督管理，对违反城乡规划进行建设的，依法予以处理。
市、县级人民政府作出房屋征收决定前，应当组织有关部门依法对征收范围内未经登记的建筑进行调查、认定和处理。
对认定为合法建筑和未超过批准期限的临时建筑的，应当给予补偿；
对认定为违法建筑和超过批准期限的临时建筑的，不予补偿。