宅基地有土地使用证的，需要向人民政府进行申请。

根据《土地管理法》第六十二条规定，农村村民住宅用地，经乡（镇）人民政府审核，由县级人民政府批准；
其中，涉及占用农用地的，应当办理农用地转用审批手续。