宅基地纠纷解决部门有：
1、一般先就近找村委会或者乡镇的政府，进行报备处理，如果已经报备处理但没有给出明确的答复，可以去县政府的土地管理部门进行调解处理。
2、可以更加直接的去找当地的土地管理部门处理此事。
3、在前者这些流程都做了之后，也就是相当于在行政登记机关处理了，农民也就可以向法院提起诉讼了。
4、其他有关部门。

《土地管理法》第十四条
土地所有权和使用权争议，由当事人协商解决；协商不成的，由人民政府处理。
单位之间的争议，由县级以上人民政府处理；个人之间、个人与单位之间的争议，由乡级人民政府或者县级以上人民政府处理。
当事人对有关人民政府的处理决定不服的，可以自接到处理决定通知之日起三十日内，向人民法院起诉。
在土地所有权和使用权争议解决前，任何一方不得改变土地利用现状。