在医疗保险费用缴纳方面出现了重复缴费的情况时，我们可以采取以下方式进行处理：
首先，如果被保险人已经按照既定的缴费基数以及比例完成了费用缴纳，那么他们可以向相关部门申请退还其本应该享受到的各项优惠政策以及补贴资金；
其次，若是被保险人没有按照规定的缴费基数及比例来缴纳保险费用，那么便需要由各个区县的医保经办机构负责对其进行核定，确定退费金额，然后再提交退费申请。
经过人力资源与社会保障局以及财政局的严格审核之后，再上报至市社保局进行复核。
最后，只有当市人力资源与社会保障局以及市财政局都批准同意之后，才能正式启动退费流程。

《社会保险法》第二十三条
职工应当参加职工基本医疗保险，由用人单位和职工按照国家规定共同缴纳基本医疗保险费。
无雇工的个体工商户、未在用人单位参加职工基本医疗保险的非全日制从业人员以及其他灵活就业人员可以参加职工基本医疗保险，由个人按照国家规定缴纳基本医疗保险费。