根据相关法律法规，保险公司在通常情况下会将赔偿金支付给被保险人，即车辆登记证书所记载的所有权人。
然而，若涉及双方交通事故，必须先获得交警部门出具的事故责任判定书，随后按照相关程序提交所需资料并计算得出最后的赔付款额，最终将款项支付给被保险人。倘若涉及到车主单方面进行理赔，则需与受害方确认是否已妥善解决本次事故纠纷；如车主不愿与第三方进行协商，可签署协议，由保险公司单独为其进行赔付，且此后该事故产生的任何费用均由车主自行承担，车主不得再向保险公司提出索赔要求。若第三方选择通过司法途径解决争议，则应遵循法院裁决结果。总之，保险公司绝不会在车主毫不知情或未同意的情况下擅自将款项支付给第三方。

《机动车交通事故责任强制保险条例》第三十一条保险公司可以向被保险人赔偿保险金，也可以直接向受害人赔偿保险金。但是，因抢救受伤人员需要保险公司支付或者垫付抢救费用的，保险公司在接到公安机关交通管理部门通知后，经核对应当及时向医疗机构支付或者垫付抢救费用。