办理健康证主要检查以下内容：
一、有没有活动性的肺结核，这需要做肺部的影像学检查，一般做的是胸正侧位片的检查。
二、有没有肠道的传染性的疾病，比如伤寒、霍乱、副伤寒，这时候往往需要做大便培养，大便培养的时候一定要注意取大便，很多人做健康证的时候往往采集大便出现了问题，这是一个要注意的细节。另外，办理健康证的时候要检查的是肝功能，通常化验是谷丙转氨酶，如果谷丙转氨酶出现两倍以上升高时候，要同时检查乙肝五项、甲肝抗体、戊肝抗体排除病毒性肝炎的情况。再者，健康证检查的是内科和外科的一些项目。

《中华人民共和国食品安全法》
第四十五条食品生产经营者应当建立并执行从业人员健康管理制度。患有国务院卫生行政部门规定的有碍食品安全疾病的人员，不得从事接触直接入口食品的工作。从事接触直接入口食品工作的食品生产经营人员应当每年进行健康检查，取得健康证明后方可上岗工作。