1、公司跨市搬迁员工跟随有补偿。
2、公司跨市搬迁员工如果愿意跟随公司搬迁的话，公司应当给予员工搬迁的安置费；
3、公司跨市搬迁员工如果不愿意跟随工厂搬迁的需要与其解除劳动合同的话，公司应当给予员工一定经济补偿金。

《中华人民共和国劳动合同法》第四十条
有下列情形之一的，用人单位提前三十日以书面形式通知劳动者本人或者额外支付劳动者一个月工资后，可以解除劳动合同：
（一）劳动者患病或者非因工负伤，在规定的医疗期满后不能从事原工作，也不能从事由用人单位另行安排的工作的；
（二）劳动者不能胜任工作，经过培训或者调整工作岗位，仍不能胜任工作的；
（三）劳动合同订立时所依据的客观情况发生重大变化，致使劳动合同无法履行，经用人单位与劳动者协商，未能就变更劳动合同内容达成协议的。