专项作业车在北京存在以下限制：
1、每天6时至23时，五环路（不含）以内道路禁止载货汽车通行，五环路主路禁止核定载质量8吨（含）以上载货汽车通行。
2、，全天禁止所有国三排放标准柴油载货汽车（含整车运送鲜活农产品的国三排放标准柴油载货汽车）进入北京市行政区域内道路行驶。
3、达不到国Ⅰ标准的汽油车和达不到国Ⅲ标准的柴油车（以下简称“黄标车”），全天禁止进入六环路（含）以内道路和远郊区县城关镇主要道路通行。
4、其他。
违反上述规定，认定为“机动车违反禁令标志指示”的违法行为，处100元罚款，并记3分。

《中华人民共和国道路交通安全法》第九十条
机动车驾驶人违反道路交通安全法律、法规关于道路通行规定的，处警告或者二十元以上二百元以下罚款。本法另有规定的，依照规定处罚。