红绿灯路口停车超过停止线不扣分。但如果车辆在红灯时已过停车线后还有明显的位置移动，也会被处罚。界定闯红灯需要电子眼抓拍到三张照片，第一张车辆驶过停止线，第二张车辆行驶到路口中间，第三张车辆到达对面路口。

《道路交通安全违法行为记分分值》第三条
机动车驾驶人有下列违法行为之一，一次记3分：
（一）驾驶营运客车（不包括公共汽车）、校车以外的载客汽车载人超过核定人数未达20%的；
（二）驾驶中型以上载客载货汽车、危险物品运输车辆在高速公路、城市快速路以外的道路上行驶或者驾驶其他机动车行驶超过规定时速未达20%的；
（三）驾驶货车载物超过核定载质量未达30%的；
（四）驾驶机动车在高速公路上行驶低于规定最低时速的；
（五）驾驶禁止驶入高速公路的机动车驶入高速公路的。