单位车辆违章处理方式有三种：
1、登陆网上车管所界面后，只要在左侧“在线办理事项”找到“交通违法”一项，点击进去就可以看到交通违法查询、确认及罚款。有一个“机场车违法查询”选项，可以查询到没有在网上车管所注册的车辆。只要输入车辆发动机号以及车辆识别代码等，可以找到最新的车辆违章信息。
2、目前支付宝已经提供了异地违章的处理通道。不过，办理异地服务违章处理会收取一定的服务费。
3、单位车辆的违章处理，按照谁开车谁负责的原则让违规的驾驶人去处理。驾驶人准备违章车辆行驶证，身份证，驾驶证以及驾驶人本人需要亲自到场。在确定自己确实违章之后，驾驶人本人携带以上三种证件去车管所或者交警大队处理即可。

《道路交通安全违法行为处理程序规定》第五十四条
对违法行为人决定行政拘留并处罚款的，公安机关交通管理部门应当告知违法行为人可以委托他人代缴罚款。