违章停车被扣3分，到下一个周期积分会自动补回来的。
道路交通安全违法行为累积记分周期(即记分周期)为12个月，满分为12分，从机动车驾驶证初次领取之日起计算。记分周期是以取得驾驶证的日期开始计算的，如果是11月4日取得驾驶证，那么明年的11月4日是一个记分期。
《道路交通安全法》第九十条
机动车驾驶人违反道路交通安全法律、法规关于道路通行规定的，处警告或者二十元以上二百元以下罚款。本法另有规定的，依照规定处罚。
法律依据：
交通法规扣分细则第六十五条

 道路交通安全违法行为累积记分周期(即记分周期)为12个月，满分为12分，从机动车驾驶证初次领取之日起计算。
依据道路交通安全违法行为的严重程度，一次记分的分值为:12分、6分、3分、2分、1分五种(附件4)。