如果汽车发动机因涉水而出现故障，且保险公司拒绝赔偿，这便涉及到了民事纠纷的范畴。在处理这类纷争时，必须遵循一般的民事诉讼程序来展开。在此过程中，通常会经历以下几个重要步骤：
首先是原告提起诉讼。原告可以采取书面或口头形式提交起诉请求。
根据第109条及110条的规定，此环节至关重要；
其次，在收到原告的诉求之后，法院将开始对其进行立案审查。经过仔细评估，法院有权批准原告的起诉请求，并正式立案。具体操作流程可参考第108条、111条及112条的相关规定；接下来便是庭前准备阶段。这个阶段主要涵盖了六个方面的工作：
1.向被告发送传票；
2.告知双方当事人各自的权利与义务，同时介绍合议庭的组成人员；
3.对相关材料进行详细审核，并收集相关证据；
4.通知所有必要的诉讼参与者参加诉讼活动；
5.发布开庭通知，并在适当范围内进行公告；
6.确认当事人及其代理人是否按时出席法庭审理。

《中华人民共和国保险法》第十六条订立保险合同，保险人就保险标的或者被保险人的有关情况提出询问的，投保人应当如实告知。投保人故意或者因重大过失未履行前款规定的如实告知义务，足以影响保险人决定是否同意承保或者提高保险费率的，保险人有权解除合同。前款规定的合同解除权，自保险人知道有解除事由之日起，超过三十日不行使而消灭。自合同成立之日起超过二年的，保险人不得解除合同；发生保险事故的，保险人应当承担赔偿或者给付保险金的责任。投保人故意不履行如实告知义务的，保险人对于合同解除前发生的保险事故，不承担赔偿或者给付保险金的责任，并不退还保险费。投保人因重大过失未履行如实告知义务，对保险事故的发生有严重影响的，保险人对于合同解除前发生的保险事故，不承担赔偿或者给付保险金的责任，但应当退还保险费。保险人在合同订立时已经知道投保人未如实告知的情况的，保险人不得解除合同；发生保险事故的，保险人应当承担赔偿或者给付保险金的责任。保险事故是指保险合同约定的保险责任范围内的事故。