三方协议和劳动合同的区别是：
1、签订时间不同。
2、主体不同。
3、内容不同。
4、目的不同。
5、适用的法律不同。
三方协议的制定、发生争议后的解决主要依据是《国家关于高校毕业生就业的规定》、《民法典》等，而劳动合同的订立以及发生争议后主要是依据《劳动法》和《劳动合同法》来解决。

《劳动合同法》第十条
建立劳动关系，应当订立书面劳动合同。已建立劳动关系，未同时订立书面劳动合同的，应当自用工之日起一个月内订立书面劳动合同。用人单位与劳动者在用工前订立劳动合同的，劳动关系自用工之日起建立。