建议协商，不行就起诉。
公司账户的钱直接通过公户网银转到个人账户即可。
做账的时候将该笔款项作为其他应收就可以了。
公司账户：
存款人以单位名称开立的银行结算账户为单位银行结算账户。

《中华人民共和国民事诉讼法》第一百二十三条
起诉应当向人民法院递交起诉状，并按照被告人数提出副本。
书写起诉状确有困难的，可以口头起诉，由人民法院记入笔录，并告知对方当事人。