借贷双方有权在借款协议中约定支付一定比例的违约金。
若借款合同中所重新约定的违约金具备了双方达成合意的真实意愿，并且不触犯任何法律以及政府出台的强制性实施条例，同时也未与公共秩序和善良风俗相冲突的话，那么则该条款所规定的新版违约金便具有有效性。
然而，假如违约金的金额与实际损失存在较大差距，人民法院或者仲裁机构将会根据争议双方中的某一方的申请，在权衡考虑后适度修正违约金的具体数值。
故此，在特定的条件下，借款协议中重新约定的违约金实际上也是合法有效的。

《中华人民共和国民法典》第五百八十五条
当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金，也可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法。
约定的违约金低于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以增加；
约定的违约金过分高于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以适当减少。
当事人就迟延履行约定违约金的，违约方支付违约金后，还应当履行债务。