借款合同有明显涂改，只要涂改过后的合同是双方都认同的，则也是具有法律效力的。如果是一方当事人在没有经过另一方当事人就擅自修改和通过内容的，隐瞒了真实意思的，并且有证据能够证明的，则该合同将会被认定为无效合同。

《中华人民共和国民法典》第五百零二条
依法成立的合同，自成立时生效，但是法律另有规定或者当事人另有约定的除外。
依照法律、行政法规的规定，合同应当办理批准等手续的，依照其规定。未办理批准等手续影响合同生效的，不影响合同中履行报批等义务条款以及相关条款的效力。应当办理申请批准等手续的当事人未履行义务的，对方可以请求其承担违反该义务的责任。
依照法律、行政法规的规定，合同的变更、转让、解除等情形应当办理批准等手续的，适用前款规定。