在经过长达两年的分居后向法院申请离婚诉讼时，以下几类证据通常被视为至关重要：
首先，具有法律效力的租房合同、水电气收费单据等书面材料，能够明确证实当事人在分居之后独立生活于其他住所的事实；
其次，来自邻居或者住宅物业的证人证言，可以作为有力的旁证，证明夫妻双方确实处于分居状态；
此外，双方之间的聊天记录、电子邮件往来等电子数据也可作为有效证据，用以证明分居的真实性以及持续时间；
最后，如果有证据显示夫妻一方在外居住期间持有暂住证等相关证件，这同样可以作为证明分居事实的有力证据。
总而言之，这些证据必须能够充分证明分居的原因在于夫妻感情破裂，并且这种状况已经持续了至少两年的时间。

《中华人民共和国民法典》第一千零七十九条
夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。
人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。
有下列情形之一，调解无效的，应当准予离婚：
（一）重婚或者与他人同居；
（二）实施家庭暴力或者虐待、遗弃家庭成员；
（三）有赌博、吸毒等恶习屡教不改；
（四）因感情不和分居满二年；
（五）其他导致夫妻感情破裂的情形。
一方被宣告失踪，另一方提起离婚诉讼的，应当准予离婚。
经人民法院判决不准离婚后，双方又分居满一年，一方再次提起离婚诉讼的，应当准予离婚。