对于分居离婚的合法程序，通常会包括以下几个步骤：
首先，双方在结束夫妻关系上达成共识，并签署离婚协议，然后亲自前往婚姻登记机关进行离婚登记。
经过法律规定的三十天冷静期过后，双方应再度赴婚姻登记机关申请领取离婚证书。
第二个途径是通过向有管辖权的法院起诉离婚，此举由法院负责审理和作出判决。
关于费用问题，若选择协议离婚，通常只需支付离婚证书的工本费即可。
然而，如果采取诉讼离婚方式，其所需费用需根据具体案件情况来确定，可能包括案件受理费、财产分割费用等等。
若案件中并未牵涉财产分割事宜，那么案件受理费大约介于五十元至三百元之间。

《中华人民共和国民法典》第一千零七十六条
夫妻双方自愿离婚的，应当签订书面离婚协议，并亲自到婚姻登记机关申请离婚登记。
离婚协议应当载明双方自愿离婚的意思表示和对子女抚养、财产以及债务处理等事项协商一致的意见。