在长期分居的情况下，可以通过协议离婚或者诉讼的途径处理。依照相关法律制度，夫妻双方倘若自愿离婚，则应该签署书面的离婚协议，并且亲自前往婚姻登记机构申请离婚登记。在满足条件的情况下，经历三十天的冷静期，即可前往婚姻登记机构申请颁发离婚证。如果是其中一方提出离婚请求，可以向人民法院提起离婚诉讼。法院在经过调解仍然没有效果，并且判定感情确已破裂时，应当准许离婚。
协议离婚流程：
1、协商达成离婚意向：夫妻双方自愿协商并达成离婚意向，确定离婚事由、子女抚养、财产分割等相关事项。
2、律师起草协议书：夫妻双方委托各自的律师起草离婚协议书，确保协议内容合法、完整、明确。
3、协议审核与修改：律师将协议书提交给法院进行审核。法院会对协议内容进行审查，确保符合法律规定和双方利益的要求。如果需要修改协议内容，律师会与夫妻双方进行沟通和调整。
4、签署协议书：经过法院审核后，夫妻双方在律师的见证下签署离婚协议书，并加盖印章（如果适用）。
5、法院审批：律师将签署好的协议书及相关材料提交给法院进行审批。法院会根据协议内容、法律规定等因素，决定是否批准离婚。
6、离婚生效：如果法院审批无异议，法院会出具离婚证书或裁定书，标志着离婚生效。

《民法典》第一千零七十九条
夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。
人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。
有下列情形之一，调解无效的，应当准予离婚：
（一）重婚或者与他人同居；
（二）实施家庭暴力或者虐待、遗弃家庭成员；
（三）有赌博、吸毒等恶习屡教不改；
（四）因感情不和分居满二年；
（五）其他导致夫妻感情破裂的情形。
一方被宣告失踪，另一方提起离婚诉讼的，应当准予离婚。
经人民法院判决不准离婚后，双方又分居满一年，一方再次提起离婚诉讼的，应当准予离婚。