无论分居多久都不会自动离婚，夫妻双方因感情不和分居满两年一方起诉到法院经调解无效应准予离婚。
离婚只有协议离婚和诉讼离婚两种方式解除婚姻关系，孩子的抚养权可由双方协商决定，协商不一致的，由人民法院根据双方的各方面条件，判决更适合小孩身心健康成长的一方抚养。

《中华人民共和国民法典》第一千零七十六条
夫妻双方自愿离婚的，应当签订书面离婚协议，并亲自到婚姻登记机关申请离婚登记。
离婚协议应当载明双方自愿离婚的意思表示和对子女抚养、财产以及债务处理等事项协商一致的意见。
第一千零七十九条
夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。
人民法院审理离婚案件，应当进行调解；
如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。
第一千零八十四条
离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。
已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。
子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿。