在房地产二级市场的交易活动中，关于设定固定违约赔偿金额为房屋总价20%的规定是否合法合规，这需要我们全面深入地评估多项综合条件后才能做出准确判断。
首先，我们必须关注到合同中所规定的条文细则以及协议双方对于该项条款所持有的真实意图为何。
只要是双方都自愿同意并签署的书面约定，并且其中没有任何形式的欺骗、恐吓或者其他违法违规的情节出现，那么这一条关于违约赔偿金额的规定就被认为是基本合法有效的。
然而，在此基础之上，我们还必须考虑违约方实际的违约行为严重性及其对守约方造成的实质性经济利益损失。
假设违约行为比较轻微，以致没有导致严重的经济损失，但违约赔偿金却设定得过高，那么违约方有权利提出适当降低赔偿金额的请求。
最后，在经过严谨的法庭调查后，法官将依据公正合理的原则以及商业道德的规范，综合考虑协议执行过程中的状况、当事人所犯错误的性质和程度等各方面因素，再来确定这个违约金的数额是否合理恰当。
因此，无论是认定20%的违约赔偿金额是合理的还是不合理的，都不能走简单化的路线，而必须针对特殊情况展开详细分析才行。