处理商品房预售合同纠纷的方式主要包括以下几个方面：首先，按照合同约定的内容予以解决。若双方在合同中并未作出明确规定，则应遵循协议优先的原则。其次，如协商无法达成共识，可申请基层组织协助进行调解。如果调解无果，可以选择向当地法院提起诉讼途径。最后，若双方签订了有效的仲裁协议或存在仲裁条款，可以向相应的仲裁机构提出仲裁申请。此外，当事人亦有权自主决定是否直接采取诉讼或仲裁的方式来解决争议。

《民法典》第四百七十条合同的内容由当事人约定，一般包括下列条款：（一）当事人的姓名或者名称和住所；（二）标的；（三）数量；（四）质量；（五）价款或者报酬；（六）履行期限、地点和方式；（七）违约责任；（八）解决争议的方法。当事人可以参照各类合同的示范文本订立合同。《民事诉讼法》第一百二十二条当事人起诉到人民法院的民事纠纷，适宜调解的，先行调解，但当事人拒绝调解的除外。《中华人民共和国仲裁法》第二条平等主体的公民、法人和其他组织之间发生的合同纠纷和其他财产权益纠纷，可以仲裁。