对于合同纠纷的处理，通常采取以下几种方式予以解决：
首先，双方当事人应尽量协商解决；
其次，也可借助于第三方介入进行调解化解矛盾；
再次，若双方均不愿意协商或调解，或者经努力仍无法达成共识，则可依据原先签订的合伙协议中的仲裁条款，或者在争议发生后双方协商一致达成的书面仲裁协议，向相应的仲裁机构提出仲裁申请。
此外，如果在合作协议中并无明确的仲裁条款，同时事后也未能就此达成书面仲裁协议，那么，双方还可以选择通过向有管辖权的人民法院提起诉讼来解决争端。

《民法典》第二百三十三条物权受到侵害的，权利人可以通过和解、调解、仲裁、诉讼等途径解决。