首先，处理拍卖合同纠纷的过程中，调解毋庸置疑被广泛视为最理想也是最佳选择之一。采用此方式，合同纠纷的各方当事人需密切配合，展开深层次且全面的谈判工作，就诸如拍卖标的物是否存在显见或潜在的缺陷等内容进行深入探讨与深度沟通，最终达成彼此理解与包容的共识。
其次，仲裁作为处理拍卖合同纠纷的关键手段之一，其裁定结果带有既定的法律效应，是以书面文件形式记录下来的判决书。双方当事人可以依据事先拟定的《拍卖合同》中所载明的条款，或者在纠纷发生之后经过充分协商达成的书面协议，将相关事宜提交至有管辖权的仲裁机构，由其依照国家相关法规及程序进行公正裁决。
最后，若以上述两种方式仍无法妥善解决合同纠纷，则合同纠纷的另一方当事人有权向当地法院提起诉讼，请求法庭对此类争端做出最终的裁决。

《中华人民共和国民法典》第五百零二条依法成立的合同、自成立时生效、但是法律另有规定或者当事人另有约定的除外。依照法律、行政法规的规定、合同应当办理批准等手续的、依照其规定。未办理批准等手续影响合同生效的、不影响合同中履行报批等义务条款以及相关条款的效力。应当办理申请批准等手续的当事人未履行义务的、对方可以请求其承担违反该义务的责任。