针对农村房屋纠纷问题，我们可采取以下几种合法且有效的方式进行解决：
首先是由争议双方进行直接的友好协商；
其次是寻求当地政府相关部门的调解协助；
再者是向具有管辖权的仲裁机构提起仲裁申诉；
最后也是最具权威性的解决方式，即诉诸于法律途径并通过法院裁决来解决争端。

《国有土地上房屋征收与补偿条例》第二十五条房屋征收部门与被征收人依照本条例就补偿方式、补偿金额和支付期限、用于产权调换房屋的地点和面积、搬迁费、临时安置费或者周转用房、停产停业损失、搬迁期限、过渡方式和过渡期限等事项，订立补偿协议。补偿协议订立后，一方当事人不履行补偿协议约定的义务的，另一方当事人可以依法提起诉讼。