关于农村房屋产权纷争的处理方式如下所述：
1.首先可以先由双方共同探讨，商议如何妥善解决当前的纠纷矛盾；
2.若双方无法达成共识，可向县级以上地方人民政府土地管理部门进行申请调解，由该部门依法做出判断并责令侵权方立即停止侵害行为，同时对受害者作出相应的赔偿损失决定；
3.倘若上述步骤仍未能有效化解矛盾，则可选择通过民事诉讼途径来解决问题。在产权调换房屋的具体位置及面积、搬迁费用、征收部门与被征收人按照相关法律法规就补偿方式、其他相关事宜等方面，双方应签订具有法律效力的补偿协议。在临时安置费或周转用房、停产停业损失、拆迁明细原、补偿金额以及支付方式等各项条款确立之后，如有任何一方当事人不愿意履行其应尽义务，另一方当事人有权依据法律规定提出诉讼请求。过渡方式和过渡期限亦需在协议中明确约定。

《中华人民共和国土地管理法》第六十二条农村村民一户只能拥有一处宅基地，其宅基地的面积不得超过省、自治区、直辖市规定的标准。人均土地少、不能保障一户拥有一处宅基地的地区，县级人民政府在充分尊重农村村民意愿的基础上，可以采取措施，按照省、自治区、直辖市规定的标准保障农村村民实现户有所居。农村村民建住宅，应当符合乡（镇）土地利用总体规划、村庄规划，不得占用永久基本农田，并尽量使用原有的宅基地和村内空闲地。编制乡（镇）土地利用总体规划、村庄规划应当统筹并合理安排宅基地用地，改善农村村民居住环境和条件。农村村民住宅用地，由乡（镇）人民政府审核批准；其中，涉及占用农用地的，依照本法第四十四条的规定办理审批手续。农村村民出卖、出租、赠与住宅后，再申请宅基地的，不予批准。国家允许进城落户的农村村民依法自愿有偿退出宅基地，鼓励农村集体经济组织及其成员盘活利用闲置宅基地和闲置住宅。国务院农业农村主管部门负责全国农村宅基地改革和管理有关工作。