房地产纠纷中，权利的界定主要依赖于房产证这一关键的法律凭据。然而，对于房屋购买协议中的支付款项的实际贡献者与持有房产证者之间的法律关联，仍需遵守相关的法律规定予以厘清。房产证在诉讼程序中只是诸多事实凭证中的一种，因此在其基础的法律关系出现明显变化或者模糊不清之时，其合法性和有效性也将受到审慎评估。如今看来，房产证已经并非判断房产权属关系的唯一依据，相关部门在判定房产权属状况时，还需要借助其他类型的间接证据进行补充证明。

《中华人民共和国民法典》第二百零九条不动产物权的设立、变更、转让和消灭，经依法登记，发生效力;未经登记，不发生效力，但是法律另有规定的除外。依法属于国家所有的自然资源，所有权可以不登记。