关于房屋认购协议中违约金的计算标准，通常需依据双方在协议中所达成的具体约定为准。
一般而言，若协议已明确规定了违约金的计算方式及具体金额，便需严格遵照这些条款来实施；
反之，若未作明文规定，那么根据我国现行法律法规以及公序良俗与诉讼实践来看，法院有可能会基于违约所导致的实际损害进行综合性评估，并在此基础上，结合合同履行状况、违约方的过错程度等诸多因素，最终确定相应的违约金金额。
其中，实际损害既包括直接经济损失（例如因违约行为而额外产生的费用），也涵盖间接经济损失（例如预期可获得的经济利益无法实现）。
在司法审判过程中，法官将对公平正义原则以及诚实行事原则给予充分考量。
若当事人认为协议中所规定的违约金数值偏高或偏低，可依法向法院提起复核申请，请求合理调整。
总的来说，具体的违约金计算标准需依托于实际情况以及关联证据加以确认。