关于购房协议中所设置违约金的计算步骤主要是遵循如下几个方面的原则性内容：
首要的考虑点在于合同本身是否已对违约金的具体计算方法以及金额大小进行了明确的规范。
若已然作出相关规定，那么此类约定通常便是用以指导我们实际操作时进行参照执行的依据。
然而，应注意的是，假设违约金的设定过高或过低，当事人均有权提出要求由法院或是仲裁机关给予适度的降幅或是提升补充。
至于合同中并未规定违约金的计算规则这一问题，依照司法体系中的现行法律规定，将以违约行为所引起的实际经济损失为基础加以评估和计算。
在损失赔偿额度的设定上，需严格遵守“补偿性”与“惩罚性”相结合的原则，即既要对违约方因此遭受的经济受损情况有所弥补，也不能超过对方在签订合同时所能预见或应当预见到的违约可能带来的潜在损失。
在司法实践过程中，法院会全面权衡各类影响因素，例如合同履行的进度、违约方的过错程度、市场行情等，从而最终确定出合理的违约金金额。