1、如果农民的一户多宅是基于转让、赠予的，即使是一户多宅也是要允许土地确权的。
这是农民的合法权益；
2、如果是农民非法占用村集体土地，擅自随意建造房屋，而形成一户多宅，对于非法占有的，要全部没收。
具体没收过程中有没有补助根据具体情况分析；
3、宅基地使用权应按照“一户一宅”要求，原则上确权登记到“户”。

《城市房地产管理法》第六十条
房地产转让或者变更时，应当向县级以上地方人民政府房产管理部门申请房产变更登记，并凭变更后的房屋所有权证书向同级人民政府土地管理部门申请土地使用权变更登记，经同级人民政府土地管理部门核实，由同级人民政府更换或者更改土地使用权证书。
法律另有规定的，依照有关法律的规定办理。
《房屋登记办法》第八十六条
房屋所有权依法发生转移，申请房屋所有权转移登记的，应当提交下列材料：
(一)登记申请书；
(二)申请人的身份证明；
(三)房屋所有权证书；
(四)宅基地使用权证明或者集体所有建设用地使用权证明；
(五)证明房屋所有权发生转移的材料；
(六)其他必要材料。
申请村民住房所有权转移登记的，还应当提交农村集体经济组织同意转移的证明材料。
农村集体经济组织申请房屋所有权转移登记的，还应当提交经村民会议同意或者由村民会议授权经村民代表会议同意的证明材料。