二者的主要区别：
1、股权转让是单体行为，并不能一定取得目标公司的控制权。
兼并收购是一个整体行为，要达到对目标公司的控制；
2、收购是原公司股东以外的第三方收购公司股权，而股权转让有股东之间的转让和向原公司股东之外的第三方转让公司股权，股权收购和资产收购的区别就是后者的税要略高于前者。

《公司法》第74条
自股东会会议决议通过之日起六十日内，股东与公司不能达成股权收购协议的，股东可以自股东会会议决议通过之日起九十日内向人民法院提起诉讼。