通常来讲，车祸伤残鉴定费一开始是由申请人先把钱垫付出去的，之后这笔费用是由有责任的那一方来承担的。
要是交通事故的责任特别清晰明了，并且经过法院的判决或者调解，把责任方给确定下来了，那么这个鉴定费就由责任方去支付。
可要是责任方对责任的认定有不同意见，然后申请重新进行鉴定，一般情况下鉴定费是由申请方先垫付的，要是最后确定责任确实是在责任方，那就是由责任方来支付鉴定费；要是责任不在责任方，那这笔鉴定费就由申请方自己承担。
另外，在某些情形下，比如说双方经过协商达成了一致意见，或者是相关的法律法规有特别的规定，那鉴定费的承担方式也就可能会不一样了。
总之，到底是以什么样的方式来承担鉴定费，得根据具体的案件实际情况以及相关的法律规定来最终确定。

案情回顾:

小朱与小李发生车祸，小朱受伤。小朱垫付伤残鉴定费后，双方对事故责任认定存分歧。小朱起诉，法院判决小李为责任方，但小李不服申请重新鉴定，垫付了新的鉴定费。新鉴定结果出来后，双方就鉴定费最终由谁承担产生争议。

案情分析:

1、最初小朱垫付的鉴定费，因法院已判决小李为责任方，按规定该费用应由小李承担。
2、对于小李申请重新鉴定垫付的费用，若新鉴定结果仍确定小李为责任方，此费用由小李承担；若新鉴定结果表明小李无责任，则该费用由小李自行承担。
3、若双方协商一致或有法律法规特别规定，则按协商结果或规定确定鉴定费承担方式。