在发生交通事故后，要是因为需要收集证据而扣留车辆的话，通常得遵循这些流程。
首先，交通管理部门会非常郑重地出具扣留车辆的凭证，明确地告知车主扣留车辆的原因，比如是为了调查事故的具体情况，或者是要获取某些关键的证据等等，同时也会清楚地说明扣留的期限大概是多久，让车主心里有数。
车主或者与事故相关的人员，一定要积极配合交通管理部门的工作，可不能故意阻碍扣留车辆的行为，不然会给处理事故带来很多麻烦。
在扣留车辆的这段时间里，车主有权利要求交通管理部门对车辆进行妥善的保管，这样就能避免车辆因为保管不当而受到损坏。
交通管理部门也会尽到自己的责任，认真做好车辆的保管工作。
然后，交通管理部门得在规定的期限内完成证据收集的工作，根据收集到的证据以及事故的具体情况作出相应的处理决定，像如果证据收集完成后发现车主没有什么责任，就会及时放行车辆；要是车主有违规行为，就会责令当事人缴纳罚款等。
要是车主对扣留车辆的决定有不同的意见或者想法，也不用担心，他可以在规定的期限内申请行政复议，或者直接提起行政诉讼，通过合法的途径来维护自己的权益。
总之，扣留车辆主要就是为了确保交通事故的调查和处理能够顺利进行，所以车主应该以积极的态度配合相关的工作，这样才能更好地解决事故问题。

案情回顾:

小朱驾车发生交通事故，交通管理部门扣留小朱车辆收集证据。交通部门出具扣留凭证，告知原因和期限，但小朱认为扣车期限过长不合理，小李作为小朱朋友认为小朱不应配合。小朱要求妥善保管车辆，部门完成证据收集后，判定小朱无责便放行车辆。

案情分析:

1、交通部门按流程扣车并告知详情，小朱若对扣车期限有异议，可在规定期限内申请行政复议或诉讼。
2、小李观点错误，车主应积极配合扣车工作，这是确保事故调查处理顺利进行的必要条件。
3、交通部门在小朱无责时及时放行车辆，履行了应尽职责。