当摩托车保险额度不足以赔偿损失时，首先可以采取的办法是与对方进行协商。
通过友好的沟通，尝试达成和解协议，让对方承担一部分损失。
这样既能避免不必要的纠纷，又能快速解决问题。
如果对方不同意协商，那么在保险赔偿范围之外的部分，就需要依据责任划分向对方主张赔偿。
明确双方在事故中应承担的责任比例，以此为依据计算对方应赔偿的金额。
与此同时，如果摩托车还有其他可执行的财产，比如车辆本身或者其他固定资产等，我们可以向法院申请强制执行。
法院会根据相关法律程序，对这些财产进行处置，以弥补我们的损失。
另外，如果自己购买了商业补充保险，一定要仔细查看保险条款，确定是否能在其范围内进行赔偿。
如果符合赔偿条件，应及时向保险公司申请理赔。
在处理这类情况的过程中，保留好相关证据是非常重要的。
例如事故现场的照片，能够清晰地展示事故发生的情况；
医疗费用凭证，用于证明因事故产生的医疗支出；
车辆维修发票，以便核算维修所需的费用等。
这些证据将在日后的维权过程中发挥重要作用。
总之，要根据具体的情况，综合运用各种措施，尽可能地减少自身的损失。
案情回顾:
小朱骑摩托车与小李发生碰撞，小朱负主要责任。摩托车保险额度不足以赔偿小李损失，小朱提出协商让小李承担部分损失，小李拒绝。小朱想申请强制执行其财产，且不清楚自己的商业补充保险能否理赔，双方产生争议。
案情分析:
1、小朱与小李协商不成时，应依据责任划分，明确赔偿比例，向小李主张保险赔偿范围之外的部分。
2、若小朱摩托车有可执行财产，可申请法院强制执行，法院会依法处置财产弥补损失。
3、对于商业补充保险，小朱需查看条款，符合条件应及时向保险公司申请理赔。
4、小朱要保留好事故现场照片、医疗费用凭证、车辆维修发票等证据，便于维权。