对于因车祸导致的保险公司对自费药品不予理赔的情况，我们可以采取以下措施进行妥善处理：
首先，您可以尝试与保险公司进行充分沟通并寻求合理解决方案；
其次，若无法达成共识，您可以向中国保监会派出机构、全国性保险行业协会以及各大保险公司总部等相关机构进行投诉反映；
最后，如果上述途径均未能解决问题，您还可以选择申请仲裁或向当地法院提起诉讼。

《中华人民共和国保险法》第二十一条
投保人、被保险人或者受益人知道保险事故发生后，应当及时通知保险人。故意或者因重大过失未及时通知，致使保险事故的性质、原因、损失程度等难以确定的，保险人对无法确定的部分，不承担赔偿或者给付保险金的责任，但保险人通过其他途径已经及时知道或者应当及时知道保险事故发生的除外。